2015-2017年盐城市乙型流感病毒HA1、NA基因分子特征

更新时间:2023-05-28

【摘要】目的对盐城市2015-2017年流行的乙型流感病毒血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase, NA)基因进行分子进化特征研究。方法将盐城市2015-2017年流感监测哨点医院以及流感暴发点采集的流感样病例咽拭子标本进行核酸、病毒分离检测定型,对选取的18株乙型流感病毒分离株采用一步法RT-PCR方法扩增其HA1基因和NA基因,扩增产物经纯化测序,采用生物信息软件从核苷酸、氨基酸以及分子进化层面对毒株进行分子特征分析。结果盐城市2015-2017年分离的乙型流感病毒HA1基因和NA基因聚类的分支关系基本一致,2015年Yamagata系毒株位于Yamagata Clade 3分支,属Phuket/3073类毒株;2016-2017年Victoria系毒株分布于Victoria Clade 1A分支,属Brisbane/60类毒株。Yamagata系所有毒株在190-helix抗原表位均发生了D196N位点的变异;Victoria系毒株共涉及2个抗原表位,120-loop抗原表位的117、129位点,190-helix抗原表位的197、199位点。盐城株未发生系内、系间重配。18株分离株未发生NA蛋白酶活性位点以及耐药位点的变化。结论 2015年Yamagata系毒株与疫苗株B/Phuket/3073/2013匹配性较好。2016-2017年Victoria系毒株HA1和NA抗原基因变异位点在积累,这些变异位点的积累很可能会导致流感病毒发生实质性的抗原性的漂移,降低与流感疫苗株的匹配度,减弱流感疫苗的保护作用。

【关键词】 乙型流感 Yamagata系 Victoria系 RT-PCR HA基因 NA基因 序列分析

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